癌症体细胞非编码突变模式的全基因组分析

Genome-wide analysis of somatic noncoding mutation patterns in cancer

（Science；IF:47.728）

癌症中体细胞非编码突变模式的全基因组分析。科学。2022

与EliezerM_VanAllen@dfci.harvard.edu :号的通信；Felix_Dietlein@dfci.harvard.edu

Abstract |

我们在代表19种肿瘤类型的3949个全癌症基因组中建立了全基因组体细胞突变事件概要。蛋白质编码事件捕获了成熟的驱动因素。组织特异性基因附近的非编码事件，如肝脏中的白麻布圣职衣或前列腺中的KLK3，以局部过客突变模式为特征，并可能反映肿瘤细胞起源印记。调控启动子和增强子区域的非编码事件通常涉及癌症相关基因，如BCL6、FGFR2、RAD51B、SMC6、TERT和XBP1，并代表可能的驱动因子。与大多数非编码调控事件不同，XBP1突变主要积累在基因启动子之外，我们使用CRISPR干扰筛选和荧光素酶报告基因分析验证了它们对基因表达的影响。从广义上讲，我们的研究为捕获整个基因组的突变事件提供了蓝图，以指导生物发现、治疗和诊断的进展。

我们在代表19种肿瘤类型的3949个全癌症基因组中建立了体细胞突变事件的全基因组汇编。蛋白质编码事件捕获了成熟的驱动因素。组织特异性基因附近的非编码事件，例如肝脏中的白麻布圣职衣基因或前列腺中的KLK3基因，表征了局部"过客"突变模式，并可能反映肿瘤细胞起源印记。调节启动子和增强子区域中的非编码事件经常涉及癌症相关基因，例如BCL6、FGFR2、RAD51B、SMC6、TERT和XBP1，并代表可能的驱动因素。与大多数非编码调控事件不同，XBP1突变主要在基因启动子之外积累，我们使用CRISPR干扰筛选和荧光素酶报告基因分析验证了它们对基因表达的影响。

总体而言，我们的研究为捕获整个基因组的突变事件提供了蓝图，以指导生物发现、治疗和诊断的进展。